Сделайте несколько задач обновления и разнесите их по времени таким образом, чтобы первая задача обновления (D:\Updates) успела завершиться перед началом выполнения второй задачи (обновление с серверов касперского). А вообще непонятен смысл таких манипуляций, компьютер домашний или в сети с KSC и т.п.