загружаю файл установки в ручную, для 64-битной системы, как там и рекомендовано
Там рекомендовано несколько не то.
А то, что в 64-битной системе разрядность устанавливаемой Java должна соответствовать разрядности браузера, с которым работаете — браузер же в 64-битных системах может быть как 32-битным, так и 64-битным. Откуда следует в т.ч. то, что если вы используется, например, 32-битную версию IE и 64-битную Firefox — то надо ставить обе версии Java.