Получается другого метода, как переустановить систему нет?
Я его просто не вижу.
Но Вы можете все оставить, как есть на данный момент.
Поскольку файлы системы, для ее работы восстановлены.
Папки недостающие и файлы в них восстановлены. Кроме одного какого-то. Но в каталоге C:\Windows\winsxs они нужны для восстановления.
Поэтому критического сейчас ничего я не вижу.
