Нашел немного информации:
http://support.microsoft.com/kb/824994/ru
Цитата:
При установке обновлением безопасности, критическим обновлением, обновлением, накопительным пакетом обновления, драйвером или пакетом возможностей файлов версии GDR файлы исправления также копируются в папку %windir%\$hf_mig$. Благодаря этому поддерживается переход к соответствующим файлам при дальнейшей установке исправления или пакета обновления с более ранними версиями этих файлов. Например, возможна следующая ситуация.
При установке обновления безопасности устанавливается версия GDR файла File.dll с номером версии 5.2.3790.1000 и в папку %windir%\$hf_mig$ копируется версия исправления файла File.dll с номером версии 5.2.3790.1000.
Устанавливается исправление, включающее версию исправления файла File.dll с номером версии 5.2.3790.0000.
В этой ситуации при установке исправления в шаге 2 устанавливается версия исправления файла File.dll (номер версии 5.2.3790.1000) из папки %windir%\$hf_mig$ вместо версии исправления файла File.dll (номер версии 5.2.3790.0000) из пакета исправлений.
Вообщем удалять не следует эту папаку, так же как и ServicePackFiles.
ie8updates - на сколько я понял это обновления толкьо IE и если вы захотите удалить IE8 вместе со всемим обновками или просто какое-то его обновление, то лучше остаивть эту папаку.
